1 puan yazan GN⁺ 2025-01-30 | 1 yorum | WhatsApp'ta paylaş
  • Bağırsak mikrobiyotasının bir parçası olan Morganella morganii, majör depresif bozuklukla olası bir nedensel sinyal gösterdi; yeni bir çalışma bunu açıklayabilecek metabolit ipuçlarının izini sürdü
  • Önceki GWAS analizi, 5.959 kişide 2.801 mikrobiyal takson ile 7.967.866 insan genetik varyantını karşılaştırmıştı; M. morganii sinyali, uzun dönem sağlık kayıtlarıyla yapılan doğrulamada da tek başına teyit edildi
  • M. morganii, IBD ve tip 2 diyabet gibi enflamatuvar zincirleme durumlarla da ilişkili olduğundan, enflamatuvar yanıtı tetikleyebilecek bakteri ürünleri başlıca aday haline geldi
  • Bulunan lipit, cardiolipin’e benziyor ancak merkez yapısı glycerol değil diethanolamine; bu madde doğal bir metabolizma bileşeni değil, endüstriyel kirletici olarak biliniyor
  • Söz konusu lipit bir TLR ligandı gibi davranarak IL-6 salınımını tetikledi; IL-6 ile majör depresyon arasındaki bağlantı da düşünüldüğünde, enflamasyon-depresyon yolu ve çevresel maruziyet etkenlerinin daha fazla doğrulanması gerekiyor

M. morganii ve majör depresif bozukluk sinyali

  • Morganella morganii, bağırsak mikrobiyotasının yaygın bir bileşeni kabul edilir; IBD ve idrar yolu enfeksiyonu gibi durumlarda ise fırsatçı patojen olabilir
  • Birkaç yıl önce yayımlanan makale, M. morganii’nin majör depresif bozuklukta olası nedensel bir rol oynayabileceğini belirledi
    • Analiz ölçeği, 5.959 kişiden elde edilen 2.801 mikrobiyal takson ve 7.967.866 insan genetik varyantıydı
    • Bu sinyal, GWAS analizindeki en güçlü nedensel sinyallerden biriydi
    • İlk mikrobiyota örneklerinden sonraki çok yıllı sağlık kayıtları incelendiğinde, yalnızca M. morganii düzeyi ile majör depresyon arasındaki ilişki doğrulandı
  • Tek bir bakteri türünün neden olabileceği varsayımı için açık bir önsel gerekçe olmadığından, olası işleyiş mekanizması temel soru olarak kaldı

Anormal lipit bulan yeni çalışma

  • Yeni makale, M. morganii’nin diğer enflamatuvar zincirleme durumlarla da kısmen ilişkili olmasından yola çıkıyor
    • Hedef durumlar arasında yukarıda anılan IBD ve tip 2 diyabet yer alıyor
    • Odak, bu tür yanıtlarla bağlantılı olabilecek alışılmadık bakteri ürünlerine yöneltiliyor
  • Keşfedilen moleküller, cardiolipin ile çok benzer bir yapıya sahip
    • Cardiolipin, birçok bakteride ve mitokondrinin iç zarında bulunan bir lipittir
    • Bu dağılım, mitokondrinin bakteriyel kökenine işaret eden kanıtlardan biridir
  • Yeni keşfedilen lipitler, cardiolipin ailesinin ortak yapısı olan diphosphatidylglycerolden farklıdır
    • Merkez yapı glycerol değil diethanolaminedir
    • Gerçek cardiolipin’e çok benzer, ancak ondan ayırt edilen bir lipit türüdür

Diethanolamine ve enflamasyon bağlantısı

  • Diethanolaminein insan ya da bakteri biyokimyasının doğal bir bileşeni olduğu bilinmiyor
  • Bu madde endüstriyel bir kirleticidir ve cardiolipin synthase gibi seçiciliği yüksek olmayan enzimler aracılığıyla düşük düzeylerde hayvan ve insan lipitlerine katılabildiği onlarca yıl önce gösterilmiştir
  • Yeni tanımlanan anormal lipitler güçlü pro-enflamatuvar özellik gösteriyor
    • TLR ligandı gibi davranıyor
    • IL-6 salınımını tetikliyor
  • IL-6 düzeylerinin majör depresyonla bağımsız olarak ilişkilendirildiği örnekler var
  • Bu bileşim, uzun süredir varsayım olarak var olan enflamasyon-depresyon bağlantısını araştırmayı sürdürmek için bir neden sunuyor; özellikle M. morganii enfeksiyon düzeyindeki artış veya diethanolamine’e çevresel maruziyetin artması gibi kötüleştirici olası etkenlerin birlikte incelenmesi gerekiyor

1 yorum

 
GN⁺ 2025-01-30
Hacker News yorumları
  • https://archive.is/QA7qZ

  • Ayrıntıya girmek zor ama 2 hafta üst üste oruç tutmak ağır depresif hâlimi kesip attı
    Neden işe yaradığını söylemek zor; arkadaşlarım, beslenme değişikliği yüzünden mikrobiyomun işin içinde olabileceğini düşünüyor
    Kulağa makul geliyor ama kanıt değil; en azından bakılacak bir yön ortaya çıktı

    • Başka bir hipotez olarak, kasıtlı ve kontrollü acının ruh hâlini yükselttiğini hep düşünmüşümdür
      Daha doğrusu, acı bittikten sonraki özgürleşme hissi; sürekli konfor içinde olmanın duygusal açıdan illa iyi olmadığı teorisi
      Oruç da bunun bir örneği olabilir
    • Davranış terapisi açısından bakınca, hayatı iyileştirmek ve depresyona karşı koymak için bir şey yapılmış olması nedeniyle etkili olmuş olabilir
      Bilişsel terapide de küçük ve anlamlı eylemlerin depresyon üzerinde büyük etkisi olabileceği kabul edilir
      Oruç tutma motivasyonu ve eylemi, ayrıca gözle görülür ve gözlemlenebilir bedensel değişimler dikkati depresyondan uzaklaştırmış, bu da depresyon belirtilerini hafifletmiş olabilir
      Depresyon hafifleyince düşünce daha berraklaşır ve bilişsel çarpıtmalar azalır; normalde ruhsal olarak sağlıklı bir kişide bu yeniden normal bir iyilik hâline yol açabilir
    • Uzun süreli oruç, sürekli besin kaynağına bağımlı zararlı bakterilerin aşırı çoğalmasını azaltabilir
      Bu makale, sindirilmemiş protein ve karbonhidratın bol olduğu ortamlarda iyi gelişen zararlı bakterilere örnek olarak Morganella morganii’yi ele alıyor
    • Sağlıklı bir beslenme düzenine döndükten sonra da depresyon azalmış hâlde kalıyorsa mikrobiyom hipotezi ilginç olur
      Aksi hâlde, oruç sırasında o kadar çok karmaşık etken var ki yalnızca buna tutunmanın zor olduğunu düşünüyorum
      Başka değişiklik yapmadan çeşitli fermente gıdaları denemek de mümkün
    • Beslenmemden buğday ve şekeri çıkararak ağır anksiyeteyi ve hafif depresyonu tamamen düzelttim
      Ailemde herkesin sindirim sorunu var ve her birimizde mikrobiyomla geçici olarak ilişkilendirilen bir hastalık bulunuyor
  • Diethanolamine:
    Genel bir açıklamayla, Diethanolamine (DEA) sabun ve yüzey aktif madde üretiminde, tarım kimyasallarında ve tekstil işlemede yaygın kullanılan bir amino alkoldür
    CO2 yakalama için emici olarak da kullanılır; toksisitesi ve kanserojen etkileri araştırılmıştır
    Diethanolamine, uzun zincirli yağ asitlerinin diethanolamide’leri ve diethanolamine tuzlarını yapmak için yaygın biçimde kullanılır; bunlar sıvı çamaşır deterjanları ve bulaşık deterjanları, kozmetikler, şampuanlar ve saç kremlerinde yer alan sabun ve yüzey aktif maddelerin formülasyonuna girer

    • DEA’nın sabun ve deterjanların endüstriyel süreçlerinde kullanıldığını açıkça belirtmek gerektiğini düşünüyorum
      Evde kendi sabununu yapan biri olarak, gördüğüm hiçbir ev tipi tarifte DEA’nın sürece eklendiğini görmedim
      Şampuanı hiç kendim yapmadığım için bir şey demem zor; başka bir ev yapımı sabun üreticisinden şampuan barı alıp kullanıyorum
      Bu gerçekten kafama taktığım bir konu; ekmeği de aynı nedenle kendim yapıyorum
      Tüketim ürünlerinin sanayileşmesinin bedenimize pek çok kirletici soktuğunu ve bunun etkilerini yeterince anlamadığımızı düşünüyorum
      Mümkün olduğu yerlerde bu oyuna katılmamaya çalışıyorum
      Ürün satın alıp zamandan tasarruf etmek karşılığında ömrü kısaltma riskini almak bana mantıklı gelmiyor
      Son yıllarda temele dönme, ne tükettiğimi sorumlulukla anlama isteği bende güçlendi
    • İçine sıvı koymadan önce bardak ve kaseleri durulamaya başladım
      Tabaktan sandviçe geçen miktar konusunda takıntılı davranmaya gerek olmadığını düşünüyorum ama kahve ya da çorba söz konusuysa bulaşık makinesinin bıraktığı deterjan kalıntısını kesinlikle yiyorsunuz
      Yüksek verimli bulaşık makinelerinin daha fazla deterjan kalıntısı bıraktığını gösteren ölçümler de vardı
    • https://www.fda.gov/cosmetics/cosmetic-ingredients/diethanol... adresine göre, DEA içerebilen yaygın bileşenler şunlardır: Cocamide DEA, Cocamide MEA, DEA-Cetyl Phosphate, DEA Oleth-3 Phosphate, Lauramide DEA, Linoleamide MEA, Myristamide DEA, Oleamide DEA, Stearamide MEA, TEA-Lauryl Sulfate, Triethanolamine
    • Evdeki birkaç şampuanı kontrol ettim; neyse ki içlerinde yoktu
      SLES vardı; onun da kendi sorunları var ama kıyaslayınca daha zararsız görünüyor
  • Keto diyeti depresyon benzeri hâlimi düzelten tek şey oldu
    Kısa süreli oruçlar tutarken keşfettim, sonra ketoyu öğrendim
    Birkaç kez denedim; ketoyu bıraktığımda 2 hafta içinde çok daha kötüleşiyorum, yaklaşık bir ay sonra da yeniden tamamen dibe vuruyorum
    Yeniden ketoya dönünce 2-3 gün keto gribi geçiriyorum ve sonra hayatta olduğum için tekrar mutlu oluyorum

    • Bağırsak bakterilerindeki dengesizlik bağırsak iltihabına, iltihap da depresyon benzeri belirtilere yol açıyor olabilir
      Bu, her zaman keto yapmak gerektiği anlamına gelmiyor; daha çok probiyotiklerle bağırsak florasını yeniden kurmak gerektiği yönünde
      Böylece belirli bakterilerin aşırı çoğalmasına izin vermeden dengeli bir beslenmeyi sürdürebilirsiniz
      Bende en iyi işe yarayan şey Lactobacyllus subtilis HU-58 ile düşük FODMAP diyetini birlikte uygulamak oldu
      Düşük FODMAP diyeti yaklaşık 1 aylık kısa bir dönemdir; ardından RENEW diyetini 3-6 aydan 1 yıla kadar sürdürmek gerekir
      Bu sürenin tamamında HU-58 takviyesi gerekir
    • En yüksek etki için kalorinin %80-90’ını yağdan alan epilepsi ketosu denenebilir
    • Christopher Palmer’ın Brain Energy kitabına bakmanızı öneririm
  • Öyleyse bu maddenin vücudumuza girmesini engellemenin basit bir yolu varken bunu sadece yapmıyor muyuz?
    “Bu Diethanolamine nereden geliyor? İnsan ya da bakteri biyokimyasında doğal bir bileşen olarak bilinmiyor. Ne yazık ki endüstriyel bir kirletici; ayrıca pek seçici görünmeyen cardiolipin synthase enzimi üzerinden düşük düzeylerde hayvan ve insan lipidlerine girebildiği onlarca yıldır biliniyor.”

    • Benim anladığım cehennem de bu
      Bu tür moleküller, onları yeterince bildiğimiz için değil, umursamadığımız için “güvenli kabul edildi”
      Bu yüzey aktif madde Diethanolamine, mitokondri zarındaki lipidlerin, özellikle Omega 3’ün normal işlevini de bozabilir
      Mitokondri zarına müdahale edince oksidatif stres ve her türlü metabolik bozukluk ortaya çıkmaya başlar
      Örneğin cardiolipin synthase eksikliği, anormal mitokondri işlevi ve morfolojisine yol açar; cardiolipin synthase (CLS) genindeki mutasyonlardan kaynaklanabilir
      Belirtiler arasında yaşam gücünde azalma, mitokondri zar potansiyelinde düşüş ve oksidatif fosforilasyon kusurları bulunur
      Yapılabilecek şeyler ters ozmoz suyu ya da deiyonize su içmek, mümkün olduğunca tam gıdalar ve taze yiyecekler tüketmektir
      Bulaşıkları elde yıkamak ve en doğal deterjanı kullanıp çok çok iyi durulamak daha iyi olur
      DEA içermeyen ürünleri bulma yöntemi: https://www.skinsafeproducts.com/search/products?products_by...
    • Çoğu şampuanın üzerinde yalnızca harici kullanım içindir uyarı etiketi var; yani en azından vücuda girmemesini sağlamaya yönelik bir miktar çaba var
  • Bu, “bilmediğini bilmemek” meselesi
    Yazı, gündelik hayatımızda yaygın olan kimyasallar ile depresyon arasında bir yolak ortaya koyuyor; bu yolakta da yaygın bir bağırsak bakterisi var
    Yazının sonucu, inflamasyon/depresyon bağlantısını çözmeye devam etmek için yeterince neden olduğu; özellikle de M. morganii enfeksiyon düzeyinin yüksek olması veya Diethanolamine’e çevresel maruziyetin yüksek olması gibi kötüleştirici etkenlere bakılması gerektiği
    Diethanolamine sıvı çamaşır deterjanlarında, bulaşık makinesi deterjanlarında, kozmetiklerde, şampuanlarda ve saç kremlerinde yaygın olarak kullanılır
    Sonuçta saç kremimin, şampuanımın, bulaşık makinesi deterjanımın inflamasyona ve depresyona yol açıp açmadığını bilemem
    Tüketiciyi koruması gereken kurumlar, bir şeyin güvenli olmadığı kanıtlanana kadar her şeyin kullanılabileceği ve ürünlere konabileceği varsayımıyla hareket ediyor
    Örneğin talidomidin doğum kusurlarına yol açacağı bilinmiyordu, bu yüzden güvenli varsayıldı
    Şirketler daha fazla para kazanmak için tehlikeli maddeleri bilerek kullanır mı? Sackler Family ve Purdue Pharma var; “Erin Brokovitch”e de bakabilirsiniz
    Eğlencesine “Matix”i de yeniden izlemeye değer

    • Bu yüzden Nassim Taleb’in Antifragile ve Skin in the Game döneminde via negativa yaklaşımıyla aşırı tartışmalı hale geldiğini düşünüyorum
      Yazılarını çok seviyorum
      “Bin yıldan eski bir sıvı değilse içme. İnsanların icat ettiği ya da yeniden tasarladığı hiçbir şeyi yeme” türünden bir iddiası var
      Argümanı basit
      İnsan son derece karmaşık, çok değişkenli bir sistem; böyle bir sistemin içine İngiliz anahtarı fırlatmak genelde berbat bir fikir
      Ancak sistem çökmekteyken bu sezgisel kural tersine dönebilir ve bu tür müdahaleler önerilebilir
      Burada biraz natüralist safsata var mı derseniz, bir ölçüde var diye düşünüyorum ama büyük değil
      Vücudumuzu mahvedebileceğimiz fikrinin kendisi apaçık
      Buna karşılık depresyon ya da ölümcül olmayan çoğu hastalık gibi daha küçük şeylerin evrim sürecinden tamamen bağımsız olduğunu düşünüyorum
      Bu yüzden hayatı iyileştirmek için kendi üzerinde deney yapmanın mümkün olduğunu düşünüyorum
      Zaman içinde yaşam kalitesi, genetik üreme başarısı olasılığıyla doğrudan bağlantılı olmamalı; gay amca hipotezinde de bu görülüyor
      Bu çıkarım yaşanılan bölgeye kadar uzanıyor
      Genetik olarak Alman kökenli hippiler California’da yaşayıp doğayla bir olduklarını iddia ediyorsa, ileri sürdükleri sağlık faydalarında dürüst olmayan bir yan var
      Çünkü bu iddia, evrimsel gelişimin gerçekleştiği bölgenin, o evrimin faydaları açısından kritik önemde olduğunu varsayıyor
      Taleb’in kendisi de genetik memleketi Lebanon’da değil NYC’de yaşıyor
      Sağlık hakkında, özellikle de yüksek üreme olasılığı dönemi olan 13-45 yaş aralığının dışındaki sağlık hakkında ne kadar az şey bildiğimiz konusunda daha dürüst olmamız gerekiyor
  • Tartışma olsun diye, buradaki bulgunun doğru, nedensel ve harekete geçilmesi gereken bir şey olduğunu varsayalım; tam olarak ne yapmak gerekir?
    Bağırsak bakterilerini saptayan teknolojiler var, ama onları hedefli biçimde düzenlemek için iyi bir yöntem yok gibi görünüyor

    • Sağlıklı beslenme, oruç, probiyotikler, stresi azaltmak gibi yöntemler var
    • Bağırsak bakterilerini etkilemenin ilginç bir yolu fekal transplantasyon
      Kulağa eğlenceli gelmiyor ve ne kadar iyi çalıştığını da bilmiyorum, ama doğru yön bu gibi
      https://www.hopkinsmedicine.org/health/treatment-tests-and-t...
    • Evden/beslenmeden/yaşamdan Diethanolamine içeren şeyleri çıkarmak yeterli olmaz mı?
  • Bununla bağlantılı olarak, Long Covid hastalarında viral inflamasyonun serotonin öncülü olan triptofanın bağırsaktan emilimini azalttığı için dolaşımdaki serotonin düzeylerinin düşük olduğu gösterildi; yazıdakine benzer şekilde bunun IL-6 ile de ilişkili olduğunu biliyorum [1]
    Triptofan, vücudun serotonin üretebilmesinin tek yolu olduğundan, serotonin eksikliği depresyon, yorgunluk, irritabilite, beyin sisi, brain zap gibi şeylere yol açabilir
    İlginç olan, bir dolambaçlı yolun bulunması
    Aynı makale, hidrolize protein, yani fiilen önceden sindirilmiş protein takviyesi alındığında, içindeki triptofan türevlerinin azalmamış başka bir hücresel emilim yolunu kullandığını da bulmuş
    Bu tür triptofan normal yiyeceklerde genellikle bulunmadığından, çok hindi yemekle çözülecek bir şey değil
    Ben bizzat denedim ve gerçekten işe yaradı
    Tıbbi tavsiye değil; sadece bende işe yarayan şeyi paylaşıyorum
    Çok yavaş başlamak gerekiyor, çünkü yıllarca serotoninden mahrum kalmış bir beynin toleransı çok düşmüş oluyor
    Vücut serotonin üretimini hız açısından sınırlasa da, “normal” bir miktar bile büyük bir sarsıntı yaratabilir ve dikkat edilmezse serotonin sendromunu tetikleyebilir
    Ben iki günde bir 1/4 porsiyondan az alıyorum
    Elbette SSRI/MAOI ya da serotonini düzenleyen başka herhangi bir şeyle kesinlikle birlikte kullanılmamalı
    [1] https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(23)01034-6

  • Yazıda da patojen olarak nadir olduğu söyleniyor
    Bağırsağımızda ya da cildimizde neler olup bittiğini bilemeyiz, ama 70’lerde NHS mikrobiyoloji laboratuvarında çalışırken bunu hiç görmedim
    Muhtemelen görsem de tanıyamazdım
    Danışmanlarımızdan biri anaerobik bakterilere takıntılıydı, belki o tanıyabilirdi; ama bir yarayla ilişkili olabilecek ya da olmayabilecek o kadar çok bakteri var ki, tanımlamak çok zor

    • Burada yaradan değil, bağırsaktaki Morganella morganiiden söz ediliyor
      Morganella morganii insan bağırsak kanalında kommensal bir ilişki içinde olabilir
      IL-6’yı artırıyorsa, düşündüğümüzden daha patojenik olabilir