Thermo Fisher'ın antikor verileri ne kadar manipüle edildi?

• Ticari antikor kataloglarındaki doğrulama görüntüleri, antikor performansını kanıtlayan satın alma öncesi dayanaklardır; ancak çeşitli Western blot görüntülerinde çevirme·döndürme sonrası aynı bantlar, fırça izi benzeri izler ve tekrarlayan arka plan gürültüsü gibi manipülasyon belirtileri tespit edildi
• Zenodo deposu, 3 Haziran 2026 itibarıyla Thermo Fisher'ın çevrimiçi birincil antikor kataloğundaki doğrulama verilerinden 450'den fazla görüntü ile Abcam'den 1 sorunlu örneği bir araya getiren sorunlu görüntüler kaydı niteliğinde
• İlk metin esas alındığında, Thermo Fisher antikor kataloğunda manipülasyon izi taşıyan 100'den fazla doğrulama görüntüsü belgelendi; belirli arka plan desenleri ise 50 doğrulama verisinde görülen tekrarlayan desen örnekleri
• Antikorlar biyomedikal araştırmalarda yaygın olarak kullanılsa da seçicilik ve özgüllük kritik önemdedir; YCharOS üyeleri 2024'te tüm antikorların %50'sinden fazlasının en az bir uygulamada başarısız olduğunu tahmin ederek bir doğrulama riski bulunduğunu belirtti
• Thermo Fisher, bazı görüntülerin web sitesindeki sunum ve netlik için ayarlanmış olabileceğini söyledi; güvenilir doğrulama verisi yoksa araştırmacılar bir antikorun performansını satın almadan önce bilmekte zorlanır ve kendi doğrulamalarını yapmaları gerekir

---

İlk bulgular ve doğrulama verisinin niteliği

• p53 proteini eksik hücre hatlarına ilişkin güvenilir veri aranırken, Thermo Fisher Scientific'in çevrimiçi antikor kataloğundaki Western blot görüntüleri sorunun başlangıç noktası oldu
• Söz konusu görüntüler, satıştaki p53 Antibody clone DO-7 Monoclonal ürününün amaçlandığı gibi çalıştığını göstermeyi amaçlayan doğrulama verileriydi
• Thermo Fisher sitesi bu görüntüleri “Advanced Verification” verisi olarak etiketledi; kurum içinde üretilmeyen katalog görüntüleri ise ayrı bir “Published Figures” bölümünün altına yerleştirildi
• Sorunlu Western blot görüntülerinin üretilmiş göründüğü belirtiliyor; açıklamalı görüntüde çeşitli bantların çevirme ve döndürme sonrası aynı biçimde olduğu görülüyor
• Ardından diğer anti-p53 antikor görüntülerinde de benzer şüpheli örnekler bulundu ve Thermo Fisher'ın 8 başka antikor ürününde 10 ek şüpheli görüntü tespit edildi

Sorunlu görüntü deposu ve sayım

• Zenodo deposu, Thermo Fisher antikor kataloğundaki doğrulama verileri içinde manipüle edilmiş görünen görüntüleri toplayan açık bir kayıt
• 3 Haziran 2026 itibarıyla üst özette verilen toplama göre, Thermo Fisher'ın çevrimiçi birincil antikor kataloğu doğrulama verilerinde 450'den fazla manipülasyon izi taşıyan görüntü ve Abcam'e ait 1 örnek bulunuyor
• İlk metne göre, Thermo Fisher antikor kataloğunun doğrulama verilerinde manipüle edilmiş görünen 100'den fazla görüntü belgelenmiş durumda
• Depoda, manipülasyon olasılığı görece daha zayıf olsa da hâlâ sorunlu olan örnekler de yer alıyor; örneğin aynı görüntünün iki farklı antikorun doğrulama verisi olarak kullanıldığı durumlar var
• Yeni bulgular, Google form üzerinden bildirilebiliyor

Başlıca manipülasyon belirtileri türleri

• Bazı görüntüler, ilk örneğe benzer şekilde birbirine aşırı benzeyen bantlar içeriyor
• Kontrast ayarlandığında belirgin “fırça” izleri görülen görüntüler var; bu da Photoshop benzeri yazılımlarla görüntünün bir bölümünün üstünün boyanmış olabileceğine işaret ediyor
• Bazı görüntüler tekrarlayan arka plan gürültüsü blokları içeriyor; bu da görüntünün bazı kısımlarının birbirine kopyala-yapıştır yapıldığını ve arka plan gürültüsü deseninde ani kopukluklar bulunduğunu düşündürüyor
• Bir vakada yinelenen arka plan gürültüsü gibi görünen bir desen saptandı; ardından Thermo Fisher'ın sattığı onlarca antikorun doğrulama Western blotlarında aynı arka plan deseni görüldü
• Bu tekrarlayan arka plan deseni, tek bir bandın ilgi duyulan proteinin konumuna uyacak şekilde asgari düzeyde düzenlenmiş hâli gibi görünüyor; ilk metin esas alındığında Thermo Fisher sitesindeki doğrulama verilerinde 50 vaka belgelenmişti
• Google Lens, Bing Images ve DuckDuckGo'nun “benzer görsel” aramalarıyla henüz belgelenmemiş yüzlerce ek örnek daha ortaya çıkarılmış durumda

Antikor doğrulamasının neden önemli olduğu

• Antikorlar biyomedikal araştırmalarda neredeyse her yerde kullanılan, ancak kullanımı zor laboratuvar reaktifleridir
• Pek çok uygulamada antikorların seçiciliği ve özgüllüğü temel koşuldur; seçicilik hedef proteine güçlü bağlanma özelliğini, özgüllük ise ilgi duyulan proteine bağlanıp diğer hedeflere çok az bağlanma özelliğini ifade eder
• Ticari olarak satılan antikorlar çoğu zaman bu ölçütleri karşılamaz; bağımsız antikor doğrulama girişimi YCharOS üyeleri 2024'te tüm antikorların %50'sinden fazlasının en az bir uygulamada başarısız olduğunu tahmin etti
• Amaçlandığı gibi çalışmayan antikorlar deneyleri haftalarca geciktirebilir; özgül olmayan antikorlar ise biyomedikal literatürdeki yeniden üretilebilirlik sorunlarının büyük nedenlerinden biridir
• Thermo Fisher gibi antikor tedarikçileri, ürünlerinin amaçlandığı gibi çalıştığını bilim insanlarına göstermek için kataloglarına doğrulama verileri koyuyor
• Doğrulama verilerindeki manipülasyon izleri, söz konusu antikorun mutlaka başarısız olduğu anlamına gelmez; ancak güvenilir doğrulama verisi yoksa bilim insanları gerçek satın alma öncesinde antikor performansını bilemez
• Thermo Fisher'da 0.1mL antikor çözeltisi içeren tek bir flakonun tipik fiyatı 400-500 dolar

Deponun amacı ve pratik mesaj

• Sorunlu görüntü deposunun amacı, aktif biyomedikal araştırmacılara tedarikçi kataloglarındaki antikor doğrulama verilerinin güvenilir olmayabileceğini bildirmek
• Bir diğer amaç ise yalnızca Thermo Fisher ile sınırlı kalmadan, tedarikçilerin sunduğu sorunlu antikor doğrulama verilerinin bulunup raporlanmasını teşvik etmek
• Antikorlar her zaman doğrudan doğrulanmalı

8 Haziran 2026 güncellemesi: Thermo Fisher'ın yanıtı

• Thermo Fisher, gözlemlerle ilgili olarak 15 maddelik bir SSS yanıtı yayımladı
• SSS'nin temel sorusu “Thermo Fisher antikor verilerini manipüle etti mi ya da üretti mi?” oldu; verilen yanıt ise “Hayır” yönünde
• Thermo Fisher, verilere ve bunların temelindeki bilime tamamen güvendiğini; antikor doğrulamasını, özgüllüğü ve doğru ürün dokümantasyonunu önemli gördüğünü belirtti
• Thermo Fisher, web sitesinde yayımlanacak antikor görüntülerini hazırlarken bazı görüntülerin sunum amacıyla netliği artırmak için ayarlanmış olabileceğini, ancak amacın alttaki deney sonuçlarını değiştirmek ya da çarpıtmak olmadığını söyledi
• Thermo Fisher, bundan sonra özgün görüntülerin bulunmadığı veya sağlanamadığı durumlarda, web sitesi kullanıcılarına antikor görüntülerinin web sitesindeki sunum ve netlik için optimize edilmiş olabileceğini bildireceğini belirtti
• SSS sayfasında “antibody images may have been optimized for presentation and clarity on the website” ifadesi 6 kez tekrar ediliyor
• Mesaj, Zenodo deposundaki görüntülere doğrudan bakıp neyin “sunum ve netlik için optimizasyon” sayılabileceğine karar verilmesi yönünde

[GN⁺]

Hacker News yorumları

• Burada birinci, ikinci ve üçüncü içgüdünün hepsinin apaçık ve özensiz bir sahtekarlık olduğunu söylememiz isteniyor. Yine de David Kriesel'in ortaya çıkardığı meşhur Xerox tarayıcı vakasını hatırlatıyor
  https://www.dkriesel.com/en/blog/2013/0802_xerox-workcentres...
  Bağlantı verilen YouTube videosunun açıklaması komik derecede isabetli: “Düşünmesi bile korkunç şeyler ölçeğinde, ‘belgeleri değiştiren tarayıcı’, ‘eti yiyen bakteriler’ ile aynı seviyededir. Xerox taramalı çok işlevli cihazlar 2006'dan beri kelimenin tam anlamıyla içerik uyduruyor. Örneğin taramada sayıları başka sayılarla değiştiriyor. Değiştirilen sayılar sayfaya kusursuz biçimde yerleştirildiği için hatayı fark etmek zor oluyor. İnanılması güç derecede sinsi geliyor ama gerçek. Reçeteler, inşaat çizimleri, her şey etkilenebilir”

  • Bu JBIG2 yüzünden miydi? Pegasus casus yazılımında kullanılan FORCEDENTRY tıklamasız saldırısında da JBIG2 kullanıldığını okuduğumu hatırlıyorum. Alakasız bir bilgi kırıntısı da olabilir
  • Faks numarasında 6 vardı ama bazen 8'e dönüşüyordu ve talihsiz biçimde bu başka bir şirketin geçerli faks numarasıydı. Üstelik bu gizli bilgiydi
    Karşı tarafın, bizim kapak sayfasındaki numaraya gönderdiğini iddia edip sonra bir kopya yollaması ve Xerox'un numarayı yanlış yaptığını doğruladığımız telefon görüşmeleri hep komik olurdu
  • Artık neredeyse tüm telefon kameraları, ayrıntıları uydurabilen AI düzeltme ile görüntüyü “iyileştiriyor”. En meşhur örnek, Samsung'un Ay fotoğraflarına detay eklemesiydi
  • İyi bir örnek ama bu yorum en üstte olduğu için hızlı okuyanlar adına söyleyeyim: bunun burada yaşananlarla hiçbir ilgisi yok

• Bunu ortaya çıkaran Sholto David düpedüz olağanüstü biri gibi görünüyor
  Wales'ten China'ya 90 günde bisikletle gittiği video: https://www.youtube.com/watch?v=MdgHZPfivVA
  Bu, ortaya çıkardığı ilk sahtekarlık da değil. 2024'te Dana-Farber Cancer Institute'daki büyük bir sahtekarlığı açığa çıkardı ve 2,6 milyon dolar aldı. Sholto gibi özgür irademizi kullanalım

  • İhbarcıların sahtekarlık uzlaşma bedelinin bir kısmını alabileceğini bilmiyordum
    “Bu hukukî uzlaşma, Sholto David'in False Claims Act'in qui tam ya da ihbarcı hükümleri kapsamında açtığı iddiaların çözümünü de içeriyor. Bu hükümler uyarınca özel kişiler ABD adına dava açabilir ve tahsil edilen tutarın bir kısmını alabilir. David bugünkü uzlaşma kapsamında 2.625.000 dolar alacaktır”
    https://www.justice.gov/opa/pr/dana-farber-cancer-institute-...
  • Emin misin? Paylaşılan videoda her gece için ayırdığı bütçe konusunda epey kaygılı görünüyor. Aa, yolculuk sanırım ondan daha önceydi

• Bunu birkaç yıl önce muhtemelen ikaros antikoruna bakarken fark etmiştim. Bariz şekilde manipüle edilmişti ama dikkat çekecek bir platform olmadığından Abcam'e geçtim ve laboratuvarımız, immünolojiyle ilgili ürünlerde asla alışveriş yapılmaması gereken şirketlerin zihinsel bir listesini tutmaya başladı

• Bu sistematik sahtekarlık ve yalnızca manipüle edilmiş verilere güvenip o antikoru kullanmayı deneyen herkes parasını ve zamanını boşa harcıyor. Benzer sorunlar yüzünden geri çekilmiş çok sayıda makale de var. Thermo Fisher, dünya çapında büyük bir antikor tedarikçisi olduğu için gerçek etkisi oldukça büyük

  • 1. Bu açıkça etik dışı ve sahtekarca bir davranış. 2. Sahtekarlığın sadece sergilenen görsellerle mi sınırlı olduğunu, örneğin görsel olmadığında satış yöneticisinin kötü bir karar verip vermediğini, yoksa alttaki araştırmanın da işin içinde olup olmadığını doğrulamak gerekir. İkincisi geçerliyse bu daha sistematik ve daha endişe verici olur. 3. Manipüle edilmiş görsellerin ortaya çıkışı ile bu ürünü kullanan araştırmaların bariz güvenilmezliği ya da yeniden üretilemezliği arasındaki ilişkiye bakmak ilginç olabilir

• Biyoteknoloji şirketlerinin hâlâ büyük bir yaygara koparmayıp False Claims Act kozunu oynamamasının tek nedeni, Thermo Fisher antikorlarının zaten kötü şöhretli derecede sorunlu olduğunun bilinmesi ve ciddi kurumların zaten hepsini kendilerinin doğrulamak zorunda olması gibi görünüyor

• Burada gösterilen “veri”nin tam olarak ne olduğu merak ediliyor. Esasen bunun “böyle bir sonuç beklemelisiniz” diyen bir pazarlama materyali mi, yoksa gerçek veri ya da mevzuata uyum için kullanılan bir materyal mi olduğu önemli.
  Temsil gücü iddiası taşımayan bir pazarlama materyali ya da eğitim amaçlı örnekse, gerçekte olduğundan sihirli biçimde daha net görünmesi belki büyük bir suç sayılmayabilir. Ama mevzuata uyum veya gerçek veri olarak güvenilmesi gereken bir materyalse oldukça kritik bir sorun.

  • Bu kasıtlı manipülasyon. Gizlice sahte veri üretmek için çok daha fazla kafa yormak gerekir; pratikteyse bir Western blot hazırlayıp taramak, kelimenin tam anlamıyla daha az iştir.
    Zaten sattıkları ürün olduğu için ürüne erişimleri de kolay; gerçekten deneyi yapmak hem daha kolay hem de daha maliyet etkindir. Ancak ancak ürünün belirtildiği gibi çalışmadığını bildiklerinde böyle bir “kanıt” uydurmaktan çıkar sağlayabilirler.
    Bu, basit bir yalan reklamı aşan; araştırmacının dikkatini ve zamanını boşa harcatan cezai ihmal niteliğinde bir davranış ve bilimsel literatürü de kirletiyor; çünkü insanlar ürün özelliklerini safça tekrar ediyor. Yazar sadece etiket spesifikasyonunu yeniden yazdığını düşünebilir, ama okur bunu yazarın kendi iddiası sanabilir.
    “Sadece pazarlama materyali olabilir, o yüzden sorun değil” diye düşünüyorsanız, tütün ya da başka lobi gruplarının bilimsel kaydı nasıl manipüle ettiğini hatırlamak gerekir. Alaycı bakarsak, bilimsel kayıt en yüksek teklifi verenin spam afiş asabildiği bir ilan duvarına dönmüşse, teknik olarak bu da pazarlama materyalidir.
  • “Bu görüntü, satıştaki antikorun amaçlandığı gibi çalıştığını göstermek içindir. Thermo Fisher sitesinde bu ‘Advanced Verification’ verisi olarak etiketlenmiştir.”
    (https://www.thermofisher.com/uk/en/home/life-science/antibod... bağlantısı)
    Teknik olarak buna pazarlama materyali denebilir, ama pazarlama materyalini bile manipüle etme ihtiyacı varsa bu, o materyalin doğruluğu açısından iyi bir işaret değildir. Reklamda bir arabanın 300mph yaptığını görüp satın aldıktan sonra gerçekte azami hızının 30mph çıkması yanıltıcı reklamdır ve müdahale gerektirir.
    Thermo Fisher’da 0.1mL antikor çözeltisi içeren tek bir vial genelde 400-500 dolar ise, satın almadan önce doğru pazarlama materyali beklemek gayet doğaldır.
  • Hangi antikoru alacağına karar verirken insanlar bu tür görsellere bakıp kalite hakkında fikir edinir. Antikorlar kusursuz değildir; araştırmak istediğiniz proteine değil başka proteinlere de bağlanabilirler.
    Kullanım amacına göre bir miktar hedef dışı bağlanma kabul edilebilir, ama çoğu zaman edilmez. Üretim sürecindeki hatalar nedeniyle tamamen işlevsiz olup hiçbir şeye bağlanmamaları da mümkündür.
    Bu sahtekârlık, normalde satın almayacağınız bir antikoru bir kez denemenize yol açıyor. Elbette hedefe özgü bağlandığını doğrulamak için kendiniz test etmeniz gerekir, ama artık başarısız olacağı baştan belli bir ürünü değerlendirmek için zaman ve para harcamış oluyorsunuz.
    Antikorların güvenilirliğinin düşük olması zaten kötü bir şöhrete sahip; çalışan bir tane bulana kadar iki ya da üç tedarikçinin ürününü denemek gerekebilir. Şimdi bu kötü şöhretin ne kadarının doğal sınırlardan değil de sahtekârlıktan kaynaklandığını merak ettiriyor.
  • Western blot’u düzgün yapmak biraz pratik ister ve dikkat edilmesi gereken birkaç tipik başarısızlık biçimi vardır. Arka plan “gürültüsü”, bulaşma/smear ve akma gibi şeyler deneyden net bir ikili sonuç çıkarmayı zorlaştırır.
    Örneğin antikorlar genelde çok özgüldür, ama safsızlıklar ya da başka proteinlere özgü olmayan bağlanmalar yorumu zorlaştırabilir. Reklam görselinde bunların temizlenmiş olması, kişinin kendi sonucuyla karşılaştırmasını çok güçleştirir.
    Özellikle jel görüntüsünde tüm bandın kaldırılması bence gerçekten yasaklanmalı.
    Normalde bu tür kataloglarda antikorun bağlanma afinitesi ya da safsızlıklarla ilgili bazı değerler olur ve yaklaşık ne beklenebileceğini anlarsınız; fakat aşırı temiz bir görüntü, kendi deney kurulumunuzda bir hata yaptığınızı sanmanıza neden olabilir. Bu kadar yaygınsa, firmanın kendi laboratuvarının çok da “temiz” çalışmadığını, jelde antikor kontaminasyonu bulunduğunu ya da kendi protokollerinde bir sorun olduğu için bunu düzenlemeyle gizlemeye çalıştıklarını hayal etmek de kolay. Bunun olası olduğunu düşünmüyorum ama gerçekten hiç iyi görünmüyor.
  • Ben buna makine ya da elektronik bileşenlerin datasheet’i gibi yaklaşırım.
    Sıradan bir tüketici olarak elektronik bileşen satın alırken, datasheet’teki “typical” değerlerin yaklaşık %90 oranında doğru olmasını beklerim. Daha büyük bir endüstriyel müşteri olsaydım, bundan daha kötü bir durumda muhtemelen oldukça sert itiraz ederdim. Yine de devredeki kritik bileşenleri bizzat doğrulamak ve ayıklamak gerekir; bu da benim sorumluluğum.

• https://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/antibod...
  “İleriye dönük olarak, orijinal görüntü mevcut değilse veya kullanılamıyorsa, şirket web sitesi kullanıcılarına antikor görüntüsünün web sitesinde gösterim ve netlik için optimize edilmiş olabileceğini bildirecektir.”
  Ne? Orijinal doğrulama görüntüsü yoksa verilmesi gereken yanıt “rastgele bir görüntü uydurduğumuzu söyleyeceğiz” değil, sadece o lanet görüntünün mevcut olmadığını söylemek olmalı. Bu, hoş bir arka plan görseli değil; bu doğrulama verisi. Veri yoksa tam olarak neyi “gösterim için optimize” ediyorsunuz?
  Bu SSS saçmalık. Düpedüz sorumluluktan kaçma metni ve sanki neyi örtbas etmeye çalıştığını bile bilmeyen biri tarafından yazılmış gibi. Kesilip yapıştırılmış ve döndürülmüş bantlar varsa, bu “gösterim için optimizasyon” değil sahte veridir.
  Elbette laboratuvarlar da yeni antikorları genelde her zaman kendileri doğrular. Ama sahte doğrulama verisine bakarak satın alınmış kötü bir antikora zaman harcamak, araştırma zamanının ve vergi mükellefi parasının israfıdır. Temel ilke şu olmalı: doğrulama verisi uydurulmaz. Yoksa yoktur. Orijinali yoksa neyi optimize ediyorsunuz? Bu, sürecin geri kalanı hakkında ne söylüyor?

  • “6. Thermo Fisher antikor verisini manipüle etti ya da uydurdu mu? Hayır.” Şunların konuşma tarzına bak. Gerçekten iğrenç.

• Bu, beceriksizce yapılmış bir sahtekârlık olduğu için kolay yakalandı. Peki ustaca yapılmış olanlardan daha ne kadar var?

• Antikor reaktif testlerini standartlaştırmaya yönelik çabalar oldu, ama ciddi biçimde yetersiz fonlandı ve yeterince değerlendirilmedi. https://ycharos.com/ (https://www.nature.com/articles/s41596-024-01095-8)

• Ne yazık ki, düzenlemelerin son derece zayıf olduğu yaşam bilimleri ve biyomedikal araştırma dünyasında ekipman ve reaktif şirketleri fiilen bir kartel yapısı oluşturuyor. Son 10-15 yılda art arda satın almalarla akıl almaz düzeyde bir konsolidasyon yaşandı; bu, sektör düzenlemeye tabi olsaydı ya da düzenleyici kurumlar azıcık olsun ilgilenseydi asla izin verilmeyecek bir seviyedeydi
  Artık pazara Merck’in MilliporeSigma birimi ile Thermo Fisher adlı iki oyuncu hakim. Bu kartel yüzünden, hem Western blot manipülasyonu gibi sahtekarlıklar konusunda hem de fiyatları istedikleri gibi sabitleme konusunda neredeyse dilediklerini yapabilecek durumdalar
  Yine ne yazık ki biyomedikal bilim insanları ortak bir düşmana karşı işbirliği yapma eğilimleriyle tanınmıyor. Elsevier/Springer Nature yayın karteline karşı zayıf tepki bile çoğunlukla bilim insanlarından değil, faturayı ödeyen üniversite kütüphane sisteminden geldi. Araştırmacının bakış açısından mesele, “Ben ne yapabilirim ki? Antikoru kendim mi üreteyim? Cam malzemeyi kendim mi üfleyeyim?” noktasına geliyor ve sonunda dişini sıkıp katlanıyor
  Bu arada, araştırma amaçlı antikorların iş akışı onlarca yıldır şöyle: 1. Araştırma dünyasının ihtiyaç duyduğu antikor yapılır. Kalite güvencesi yapılmaz; çünkü pahalıdır ve gereksiz görülür. 2. Genellikle kanıt olmadan, artık ise gerekirse kanıtı uydurarak, bu antikorun belirli bir kullanımda işe yaradığı iddia edilir. 3. Araştırmacılar antikoru satın alır ve kalite güvencesini onların yapmasına bırakılır. Antikor çalışmasa bile, iade almak için uğraşan alıcı sayısı son derece azdır. 4. Kâr edilir. Boş zamanı olan ender bir bilim insanı, antikorun açıkça işe yaramadığını şüpheye yer bırakmayacak biçimde gösterse bile satış sürer. 5. Yeterince fazla kişi sahtekarlığı fark edip satışlar düşmeye başlayınca antikor üretimden kaldırılır. Açıklama yapılmaz. 6. 1. adımdan itibaren tekrar edilir