1 puan yazan GN⁺ 2026-05-02 | 1 yorum | WhatsApp'ta paylaş
  • J. Craig Venter, Ph.D., 29 Nisan 2026 tarihinde San Diego’da 79 yaşında hayatını kaybetti; yakın zamanda teşhis edilen kanser için gördüğü tedavi sırasında ortaya çıkan beklenmedik bir komplikasyonun ardından kısa bir hastane yatışından sonra vefat etti
  • Venter, J. Craig Venter Institute bünyesinde kurucu, yönetim kurulu başkanı ve CEO olarak modern genomiğin şekillenmesine katkı sağladı ve sentetik biyolojinin doğuşunu etkiledi
  • National Institutes of Health’te expressed sequence tags (ESTs) temelli gen keşfinin öncülüğünü yaptı; insan genomunun ilk taslak dizisinin ve ilk yüksek kaliteli diploid insan genomunun yayımlanmasına liderlik etti
  • Venter ve ekibi, kimyasal olarak sentezlenmiş bir genom tarafından kontrol edilen ilk kendi kendini kopyalayan bakteri hücresini inşa ederek genomların dijital olarak tasarlanıp canlı hücreleri çalıştıracak şekilde başlatılabileceğini gösterdi
  • Sorcerer II Global Ocean Sampling Expedition ile denizel mikrobiyal çeşitliliği araştırarak milyonlarca yeni gen keşfettiklerini bildirdi; ayrıca Synthetic Genomics, Human Longevity ve Diploid Genomics şirketlerinin kurucu ortakları arasında yer aldı

Ölüm ve enstitünün açıklaması

  • J. Craig Venter, Ph.D., 29 Nisan 2026 tarihinde San Diego’da 79 yaşında hayatını kaybetti
  • Ölüm nedeni, yakın zamanda teşhis edilen kanserin tedavisi sırasında gelişen beklenmedik bir komplikasyon oldu; kısa bir hastane yatışının ardından vefat etti
  • Venter, J. Craig Venter Institute bünyesinde kurucu, yönetim kurulu başkanı ve CEO idi
  • JCVI başkanı Anders Dale, Venter’ın bilimin farklı düşünerek, kararlılıkla hareket ederek ve henüz var olmayan şeyleri yaratarak ilerlediğine inandığını söyledi
  • JCVI, genom biliminin ilerletilmesi, keşifleri mümkün kılan kamu yatırımlarının savunulması ve bilgiyi gerçek etkiye dönüştüren geniş iş birliklerinin sürdürülmesi yönündeki çalışmalarını devam ettireceğini açıkladı

Genomik ve sentetik biyolojideki rolü

  • Venter’ın çalışmaları modern genomiğin tanımlanmasına katkıda bulundu ve sentetik biyoloji alanının doğuşunu da etkiledi
  • Disiplinler arası ekipler kurdu, cesur fikirleri ve daha hızlı yöntemleri öne çıkardı, keşiflerin gerçek dünyada etkiye dönüşmesi gerektiği ilkesini vurguladı
  • Güçlü bir federal bilim bütçesini ve devlet, akademi ve sanayi genelinde ilerlemeyi hızlandıran iş birliklerini destekledi
  • Kariyeri boyunca genomiğin, yavaş ilerleyen gen-gen keşif yaklaşımından ölçeklenebilir bir veri odaklı bilim alanına dönüşmesine katkı sağladı
  • Daha sonra araştırmalarını, genomların tasarlanıp inşa edilebileceğini kanıtlama aşamasına kadar genişletti

Başlıca bilimsel başarıları

  • EST ile gen keşfi

    • National Institutes of Health’te expressed sequence tags (ESTs) kullanılarak gen keşfine öncülük edilmesine katkı sağladı
    • EST yaklaşımı, çok sayıda insan geninin hızla tanımlanmasını mümkün kıldı ve genom haritalama çalışmalarını hızlandırdı
  • İnsan genomu taslağı ve diploid genom

    • İnsan genomunun ilk taslak dizisinin oluşturulmasına liderlik ederek biyolojinin dijital çağa girişinde dönüm noktası yarattı
    • Daha sonra çalışma arkadaşlarıyla birlikte ilk yüksek kaliteli diploid insan genomunu yayımladı
    • Bu başarı, her iki ebeveynden miras alınan genetik varyasyonların yakalanmasının önemini ortaya koydu
  • Sentetik genomla çalışan hücre

    • Venter ve ekibi, kimyasal olarak sentezlenmiş bir genom tarafından kontrol edilen ilk kendi kendini kopyalayan bakteri hücresini inşa etti
    • Bu başarı, genomların dijital olarak tasarlanabileceğini, kimyasal bileşenlerden üretilebileceğini ve yaşayan bir hücreyi çalıştırmak için “boot” edilebileceğini gösterdi
  • Denizel mikrobiyal çeşitliliğin incelenmesi

    • Sorcerer II Global Ocean Sampling Expedition kapsamında metagenomik aracılığıyla geniş ölçekli denizel mikrobiyal çeşitlilik araştırıldı
    • Milyonlarca yeni gen keşfettiklerini bildirdi ve bilinen protein ailelerinin kapsamını genişletti
    • Bu çalışma, okyanus mikrobiyomu ve onun gezegensel sistemlerdeki rolüne dair anlayışı derinleştirdi

Kurumlar ve şirketler inşa etmesi

  • Venter, büyük bilimsel zorlukların üstesinden gelmek için tasarlanmış ekipler, platformlar ve kurumlar kuran bir isimdi
  • J. Craig Venter Institute’u kurdu ve genomik ile sentetik biyoloji araştırmaları için kurumsal bir temel oluşturdu
  • Seri girişimci olarak Synthetic Genomics, Inc., Human Longevity, Inc. ve Diploid Genomics, Inc. şirketlerinin kurucu ortakları arasında yer aldı
  • Bu şirketlerdeki faaliyetleri, genomik ve sentetik biyolojiyi sağlık ve toplum için araçlara dönüştürme çabalarına uzandı

JCVI’ye genel bakış ve sonraki adımlar

  • JCVI, Maryland Rockville ve California La Jolla’da bulunan kâr amacı gütmeyen bir araştırma kuruluşudur
  • JCVI, genomiğin ilerletilmesi, toplumsal etkilerinin anlaşılması ve araştırma sonuçlarının bilim dünyası, kamuoyu ve politika yapıcılara aktarılmasına odaklanır
  • Yaklaşık 120 bilim insanı ve çalışan; sentetik biyoloji, insan ve evrimsel biyoloji, genetik, biyoinformatik/enformatik, bilgi teknolojileri, yüksek verimli DNA dizileme, genom ve çevre politikası araştırmaları ile bilim ve bilim politikası alanında kamu eğitimi konularında çalışmaktadır
  • JCVI, 501(c)(3) statüsünde bir kuruluştur
  • Enstitü, Venter ailesinin mahremiyetine saygı gösterilmesini istedi ve anma ile ilgili ek bilgilerin mümkün olduğunda paylaşılacağını belirtti

1 yorum

 
GN⁺ 2026-05-02
Hacker News yorumları
  • Onunla teknesinde birlikte yarışmıştım. Bir keresinde bir jibe sırasında denize savruldu ve mainsheet gövdesine dolandı
    Suyun altına çekilirken bile bir şekilde küpeşteyi tutunmayı başardı; ben de kuru elbisesinin halka kısmından yakalayıp onu tekrar tekneye çekebildim
    İlginç bir insandı; Vietnam Savaşı sırasında sıhhiye eri olarak görev yaptı ve eski teknesi Sorcerer II, 2003~2010 arasındaki Global Ocean Sampling Expedition için platform oldu; bu sayede milyonlarca yeni deniz mikrobu geni keşfedildi
    Çok dost da edindi, epey düşman da, ama kendine özgü tuhaf ve harika biçimiyle dünyada dolu dolu bir insan hayatı yaşamış gibi görünüyor

    • Sadece 79 yaşındaydı; dolu dolu bir insan deneyimi için fazla kısa. Özellikle de en parlak insanların burada kendilerine verilen zamanın bu kadar az olması çok üzücü
  • Çocukken onunla yapılmış bir 60 Minutes röportajını izlemiştim. Olimpik yüzücü olma hayalinden vazgeçtiğini, üniversiteyi bıraktığını, ardından Vietnam'da sıhhiye eri olarak görev yaptığını ve bir donanma gemisinden atlayarak intihara teşebbüs ettiğini ama neredeyse olimpik düzeyde bir atlet olduğu için hayatta kaldığını anlatmıştı
    Daha sonra Cornell University'de, eski dostu genetikçi Andy Clark ile birlikte insan genomu üzerine konuşma yaparken onu bizzat gördüm; uzundu, çok baskın bir varlığı vardı ve keldi
    Birkaç yıl sonra San Diego'ya taşınıp sörfe başladım; bir sörf sitesine bakarken bir anda Craig Venter'ı lüks saat reklamında gördüm. Denizde yelken yapıyordu ve muhtemelen o dönemde benim yüksek lisans geçim bütçemden daha pahalı bir Jaeger-LeCoultre saat takıyordu
    Ardından birkaç yıl sonra şirketlerinden biri olan Synthetic Genomics'te mülakata girdim; biyoinformatik ekibi, şirketin çok fazla yön değiştirmesi nedeniyle oldukça dağınık görünüyordu. Biyoyakıt üretiminden, insanlara nakledilebilir böbrek üretmek için domuzları genetik olarak değiştirmeye geçmişlerdi ve birkaç yıl içinde bu fikir gerçekten işlemeye başlamıştı
    Sonuçta Venter ve başarıları, biyoloji, genetik, biyoinformatik ve makine öğrenmesi alanlarındaki tüm yetişkinlik kariyerimin arka planında hep vardı. Büyük bilimi gerçeğe dönüştürmek için bazen ezici bir kişiliğe sahip figürler gerekir

    • Güzel hikâyeler. Biyoyakıttan yön değiştirdikten sonra ona domuz işiyle ilgili soru sormuştum. Sanırım Exxon'dan 150 milyon dolar toplamıştı
      Yanlış hatırlamıyorsam, SeriusXM ve United Therapeutics'i kuran meşhur girişimci Martin'le, yani artık Martine Rothblatt'la çalışmıştı
  • İronik biçimde, hayatının son birkaç yılını ömür uzatma üzerine harcıyordu[1] ve bunu karşılayabilecek insanlara 25.000 dolarlık “önleyici sağlık hizmeti” danışmanlığı satıyordu[2]
    1: humanlongevity dot com şirket sitesine ele geçirilmiş gibi görünüyor ve “captcha” bahanesiyle trojan yükletmeye çalışıyor. Bu yüzden onun yerine Wikipedia sayfasını bırakıyorum: https://en.wikipedia.org/wiki/Human_Longevity
    2: https://fortune.com/2017/02/21/craig-venter-human-longevity/

    • Kanseri vardı ve ölüm nedeninin tedaviyle ilgili bir şey olduğu anlaşılıyor
  • Craig Venter, Human Genome Project'teki rolüyle tanınır. Başkan Clinton ve Francis Collins ile birlikte insan genomunun ilk taslağını duyurdu

    • “Rol” demek, kamu verilerini alıp buna özel olarak ürettikleri az miktarda veriyi ekleyerek ilk montajı elde etmeye çalışmaları anlamına daha yakın
      Human Genome Project bilim insanları, onun her şeyi patentleyip başkalarını para ödemeye zorlamak istediğini düşünüyordu. O dönemde neyin patentlenebilir olup neyin olmadığı net değildi
      Bu yüzden onun rolü, kamu projesini genom montajı yarışına girmeye teşvik etmekti; bu da kamu tarafının baştan tamamen planlamadığı devasa bir hesaplama problemiydi
      https://archive.is/2022.02.14-091753/https://www.nytimes.com...
    • Hatta bir bakıma Human Genome Project'in kendisiydi de denebilir. Bildiğim kadarıyla örneklerden birinin kendisi olmasını sağlamıştı
  • Oldukça temkinli bilim insanlarının egemen olduğu bir alanda, iyi anlamda epey sarsıcı bir girişimci ve mucitti
    Elbette o bilim insanları da harikaydı ama onun yaptığını yaptığı zamanda, genomun 10~20 yıl içinde çözülmesi pek olası görünmüyordu. Kültürel olarak 1980'lerdeki NASA'ya benzeyen bir alanda adeta bir Apollo Project yürüttü

    • Benim anladığım kadarıyla Hamilton Smith, shotgun sequencing'in işe yarayacağını ısrarla savunuyordu
      NIH tarafı, Celera genomu fazla hızlı biçimde monte etmeye başlayana kadar primer walking'de ısrar etti; sonra NIH de shotgun yaklaşımına katılmak zorunda kaldı
    • Biyoloji lisansı yaptım ve hocalarımdan biri bu işin içindeydi. Hoca, Human Genome Project'in Celera'dan önce bittiğini ve Venter ekibinin shotgun yaklaşımının çalışabilmesi için temelde HGP'nin yayımladığı referans veriye dayanmak zorunda olduğunu güçlü biçimde savunuyordu
  • Craig Venter'a rahmet diliyorum
    İlkokul 5. sınıftayken Human Genome Project hakkında bir şeyler duyduğumu hatırlıyorum. O zamanlar radikal bir girişim olarak sunuluyordu
    Aradan 30 yıl geçti; şimdi ne kadar ileri geldiğimize bakın. Birkaç gün önce UK Biobank sızıntısı hakkında okudum (https://news.ycombinator.com/item?id=47875843); önemli sayıda tam insan genomunun sızdırıldığından söz ediliyordu. İnsanların bir zamanlar Craig Venter'ı ne kadar önden giden biri olarak gördüğünü düşündürdü

  • Üzücü haber. Sanırım yaklaşık 10 yıl önce bir konferansta Craig'le çok kısa süreliğine tanışmıştım
    O sırada genetiği neredeyse kendi kendime öğreniyordum; Craig'in seviyesinde değildim ama konuşmaya çok istekliydi ve düşünceli biçimde zaman ayırdı

  • Küresel, hatta belki kozmik ölçekte benmerkezci bir figürdü ve ilk diploid insan genom dizisini yayımladı. Bu, kendi DNA'sıydı
    Başarılarını insan izleyicilere duyurmakla da yetinmedi. “Genomum dizilendikten sonra yazılımım elektromanyetik dalgalar biçiminde uzaya gönderildi ve genetik bilgimi Dünya'nın çok ötesine taşıdı” demişti

  • Ondan kalma ilginç bir alıntı var

    SPIEGEL: O halde Collins'i gerçek bir bilim insanı olarak görmüyor musunuz?
    Venter: Ona sadece devlet bürokratı diyelim

    https://www.science.org/content/blog-post/craig-venter-venti...

  • Tüm genom dizisinin yayımlandığı sırada moleküler biyoloji stajyeriydim. Laboratuvarda bir thermal cycler vardı ve kullanım saatlerini kâğıt bir çizelgeye yazarak rezerve etmeniz gerekirdi
    Birkaç rafta sıkışık biçimde dizilmiş thermal cycler'ların önünde durduğu bir fotoğrafını hatırlıyorum. Bana ölçek hakkında bir şey öğretti ve bazen elinizdekine bakıp “Bunu 200 katına çıkarırsak ne olur?” diye sormanın değerli olduğunu gösterdi
    Yazılımda GPU dizileri gibi şeyleri düşününce bu bariz gelebilir ama ıslak laboratuvarlara ve cihazlar için kâğıt rezervasyon çizelgelerine alışkın biri için durum farklı. Yaşam bilimlerinde de bazen kaba kuvvetle ölçek büyütme uygulanabilse daha fazla atılım olabilir mi diye düşünüyorum

    • Ben istatistikçiyim, eşim de temel biyoloji bilimlerinde çalışıyor. Eşim deneyler hakkında fikir sorduğunda neredeyse her seferinde örneklem büyüklüğünü 10 kat artırmasını söylemek istiyorum
      Ama akademide örneklem büyüklüğünün ne olması gerektiğine dair kalıplaşmış fikirler var ve radikal biçimde daha büyük örneklemler kullanmaya kalkınca hayvan deneyleri etiğinden araştırma fonlarına kadar türlü engelle karşılaşıyorsunuz
      Sonuçta 12 örneklem büyüklüğüyle öğrenebileceğiniz şeylerin bir sınırı var. Size hiçbir şey öğretmeyen 12 farelik deneyleri tekrar tekrar boşa harcamak mı, yoksa 100 fare kullanıp yalnızca en devasa etki büyüklüklerini değil gerçekten ayırt edecek istatistiksel gücü elde etmek mi daha etik, emin değilim
    • Laboratuvar otomasyonu işindeyim; kâğıt çizelgelerden gerçekten çok yol geldik. Tabii böyle çizelgeler hâlâ epey yaygın :)