1 yorum

 
GN⁺ 3 일 전
Hacker News görüşleri
  • 2010’da amiloid agregatları üzerine lisans araştırması yapıyordum ve motivasyon Alzheimer’dı
    O dönemde çıkan makalelere bakınca bile bunun hastalığın doğrudan bir mekanistik bağlantısı olmaktan çok fiilen bir semptom olduğu epey açıktı
    Bunun üzerinden 16 yıl geçti bile

  • O zamanlar bir biyolojik model vardı, bu modelde aktivite gösteren birkaç ilaç da vardı ve insanlarda da bir miktar etki sinyali görülüyordu
    Sorun, modelin kendisinin yanlış olabilmesi ve Pharma’nın hayal edilebilecek en büyük pazarı kovalayıp buna milyarlarca dolar yakmış olmasıydı
    Bunun dolandırıcılık mı yoksa sadece yanlış bir hipotez mi olduğu ayrı mesele; insan biyolojisi hakkında hâlâ bilmediğimiz çok şey var
    İlaç sektörünün işlemeye devam etmesinin sebebi de sonuçta bu kusurlu tahminlerin bazılarının belli ölçüde doğru çıkması olabilir
    Bakmak isterseniz In the Pipeline bloguna göz atın

    • Ortada dolandırıcılık olması, amiloid hipotezinin otomatik olarak yanlış olduğu anlamına gelmez
      Elimizdeki modeller arasında hâlâ en iyisi olabilir; en fazla, temelinin düşündüğümüzden daha zayıf olduğu anlamına gelir, kesin bir çürütme değil
      [1] https://www.astralcodexten.com/p/in-defense-of-the-amyloid-h...
    • Derek Lowe’un blogu gerçekten çok iyi ve Alzheimer etiketinde tam 192 yazı var
      https://www.science.org/topic/blog-category/alzheimers-disea...
      Daha eğlenceli tarafta ise buna da bakılabilir
      https://www.science.org/topic/blog-category/things-i-wont-wo...
    • Yanlış model ile dolandırıcılık aynı şey değildir
      Biyolojide makul görünen ama sonradan eksik ya da yanıltıcı olduğu anlaşılan çok fazla model var
    • İnsan biyolojisinin tüm ayrıntılarını bilmediğimizi söylemek neredeyse totoloji gibi geliyor
      X her neyse, X’in tüm ayrıntılarını bilmediğimizi söylemek her zaman doğrudur
    • Bunun dolandırıcılık mı yoksa basit bir hata mı olduğu aslında daha önemli
      Burada bilim sisteminin ne kadar bozuk olduğunu görmemiz gerekiyor ve bunu düzeltmezsek önümüzdeki yıllarda da on yılları ve milyarlarca doları kaybetmeye devam etmemiz çok olası
  • Bu makaleye de sürekli dönüyorum
    https://www.statnews.com/2019/06/25/alzheimers-cabal-thwarte...
    Alıntıda da dendiği gibi, amiloid tarafı bir komplo grubu olmaktan çok kendilerinin haklı olduğuna içtenlikle inanıyordu ve fon ile ilgiyi oraya yığmanın en iyi seçenek olduğunu düşünüyordu gibi görünüyor
    Ama sonuçta grup düşüncesi tıbbi araştırmalardaki ilerlemeyi on yıllarca geciktirebiliyor
    Bu sadece Alzheimer’a özgü bir durum değil; FDA onay kültürü de sorumluluktan kaçınmaya çok eğilimli olduğu için birçok hastayı kurtarabilecek risk profillerini benimsemekte başarısız oluyor gibi görünüyor

    • Ama bu alandaki FDA tarihine bakınca, aslında etkinlik kanıtı zayıf ilaçları ve ciddi yan etkileri fazla kolay kabul etmiş tarafa daha yakın görünüyor
      Alzheimer alanında FDA’nın hasta/bakım veren gruplarıyla ilaç şirketlerinin peşinden gitmek yerine etkinlik kanıtı konusunda daha katı olması belki daha iyi olurdu
    • Bu durum biraz yazılım mimarisine de benziyor
      Başta bir framework ya da pattern seçip her şeyi onun üstüne kurunca, sonradan temelin yanlış olduğuna dair kanıt çıksa bile geçiş maliyeti öyle büyüyor ki bozuk bir temel üstüne inşa etmeye devam etmek daha ucuz hale geliyor
      Amiloid hipotezi bir tür teknik borç gibi ve "kabal" da komplodan çok batık maliyeti rasyonel biçimde savunma hali gibi görünüyor
    • Bilim için bir seferde bir cenaze kadar ilerler denir; umarım LLM/AI burada biraz fark yaratır
      Küçük oyuncuların da eskiden erişemedikleri kaynakları kullanıp yerleşik görüşe karşı sonuçlar üretebilmesini isterim
      Yoksa mevcut baskın akran grubunun çekilmesini beklerken benim Alzheimer’a yakalanmamamı ummak zorundayım
    • Bilim dünyasında bu gerçekten çok sık olur
      Bir kez yaygın kabul gören gerçek X haline geldi mi, X’e karşı çıkan ya da X’in yanlış olduğunu gösteren makalelerin yayımlanması zorlaşır ve sonunda fon da kurur
    • O makaleyi ilk okuduğumda öfkelenmiştim ama son dönemdeki gelişmeleri takip ettikçe ben de benzer bir sonuca vardım
      Çokça nefarious, fraud, corrupt gibi kelimeler kullanıldı ama birilerinin aktif olarak zarar vermeye çalıştığını düşünmüyorum
      Asıl zarar grup düşüncesinden ve başka nedenleri araştıracak kaynakların emilmesinden geldi
      Eskiden HN’de Alzheimer araştırmacısı olduğunu söyleyen biri, alternatif hipotezler için fon alabilmek adına teklif metnine en azından biraz beta amyloid serpiştirmek zorunda kaldıklarını yazmıştı; bunu hatırlıyorum
      Her şey tamamen israf mıydı derseniz, o da değil; şimdi görünen o ki beta amyloid hâlâ işin içinde ama Alzheimer çok etkenli bir hastalık
      Araştırma sistemi yeni fikirlere daha açık olsaydı bu diğer nedenler onlarca yıl önce araştırılmaya başlanmış olurdu
  • Bence en büyük sorun Abeta 42 peptide fragment’ın neden olarak sabitlenmesiydi
    Bu tür tek hedefli saplantı, takım oyuncularını ödüllendiren araştırma fonu yapısıyla çok iyi uyuştu
    Karl Herrup’un How Not to Study a Disease kitabı bu konuyu ele alan harika bir eser; epey düşman edinmiş olabilir ama bence genel olarak doğru şeyler söylüyordu
    Güncel uzlaşı, Alzheimer dediğimiz şeyin aslında heterojen bir hastalıklar kümesi olduğu ve birden fazla etkenin birlikte katkıda bulunduğu yönünde

    • Bu bir makaleden çok neredeyse podcast dökümü gibi görünüyor ama burada bu kilitlenmenin fiilen dolandırıcılık yüzünden yaşandığı söyleniyor gibi
      İstenen sonucu üretmek için bazı verilerin kasıtlı olarak manipüle edildiği iddia ediliyor ve katılımcılardan birinin bu konuda başka bir kitap yazmış bir yazar olduğu söyleniyor
      Doğruluğunu garanti edemem ama en azından bundan çok daha az masum bir şey olduğu kanaatindeyim
    • Bu bana şizofreniyi hatırlatıyor
      Sanki çok iyi anlamadığımız farklı şeyleri bir araya toplayıp tek ve geniş bir etiket yapıştırmışız gibi
    • Podcast’te adı geçen başka bir kitap olan Doctored da benzer bir noktaya değiniyor
      Neredeyse sahte denebilecek "bilim" yüzünden muazzam miktarda para ve araştırma fiilen kurgu gibi bir yöne akmış
      İnsanlar "the science"ı övdüğünde aslında bilimsel yöntemi kastediyor, ama o yöntemi uygulayanların kusurlu ve bazen egosu yüksek insanlar olduğu gerçeği sık sık unutuluyor
  • En azından bazı Alzheimer türlerinde amyloid-beta’nın nedensel olarak rol oynadığına dair genetik kanıt hâlâ çok güçlü
    Lecanemab ve Donanemab gibi ilaçların ilerlemeyi yavaşlatması da bence amiloid hipotezini destekleyen güçlü bir kanıt
    Asıl engel, amyloid-beta’nın patolojik biçimini hedeflemenin zor olmasıydı ve ilaç şirketleri nedense beyindeki katı amiloid kitlelerine daha çok odaklandı
    Geliştirmenin yavaş ilerlemesinin büyük nedeni, ilaç geliştirme süresinin zaten çok uzun olması
    Yeni bir bileşiğin gerçek hastalara ulaşmadan önce sadece güvenlik çalışmaları bile 2-3 yıl sürüyor ve Alzheimer gibi yavaş ilerleyen hastalıklarda, mucizevi bir ilaç değilse etkinliği görmek için en az 2 yıl takip gerekiyor

    • Ne yazık ki Lecanemab ve Donanemab’ın semptomları anlamlı biçimde iyileştirdiğine dair kanıt çok zayıf görünüyor
      En güncel sistematik derleme de bunu söylüyor, ama bu amiloidin hiçbir rolü olmadığı anlamına gelmiyor
      Sadece tedavi için artık çok geç bir aşamada olabiliriz
      [0] https://www.cochrane.org/evidence/CD016297_are-medicines-ant...
  • Kötücüllükten önce beceriksizliği düşünmek gerekir denir ama bence Alzheimer sonuçta yaşlanmanın bir ürünü
    Ve yaşlanmanın kendisi de güçlü bir ideolojik ters rüzgârla karşılaşıyor; bu yüzden sağlık sistemi kök neden yerine ancak hastalık şeklindeki semptom kümelerini ele almaya çalışıyor
    Dolayısıyla Alzheimer dediğimiz semptom demetini tedavi etmek doğal olarak daha da zorlaşıyor

    • Alzheimer’ın tek başına en güçlü öngörücüsü yaş
      Buna rağmen NIA’nın 2025 mali yılı için 4,5 milyar dolarlık bütçesinin yaklaşık %60’ı Alzheimer ve ilişkili demanslara gidiyor; yaşlanmanın temel mekanizmalarını araştıran Division of Aging Biology ise sadece %9 alıyor
      İçeride yapılan şakalarda NIA’daki A’nın Aging değil Alzheimer’s anlamına geldiği söyleniyor
      Daha da acı olan şu ki, sonradan AD olan insanlar arasında bilişsel gidişatı modellediğinizde test puanı varyansının yaklaşık yarısı tek başına yaşla açıklanabiliyor
      Yaşlanma saatine, hastalığın kendisinden 7 kat daha az kaynak ayırıyoruz
    • Toplum olarak anne babalarımızın ve büyükanne büyükbabalarımızın ölümünü o kadar kanıksamışız ki farklı düşünmek neredeyse imkânsız görünüyor
      Keşke yaşlanmayı doğal olduğu için iyi bir şey gibi görmek yerine hastalık olarak ele alsak
  • Beyin bir dinamik sistem ve onu hâlâ çok eksik anlıyoruz
    Çöküş yaşamamak için sürekli çalışan aktif bakım süreçlerine ihtiyaç var ve uykusuzluğun sonunda ölümcül olabilmesi de muhtemelen bununla bağlantılı
    Bilim, ilgili süreçleri listeleme aşamasında bile hâlâ çok geride; nasıl çalıştıklarını tamamen anlamaktan ise çok daha uzağız
    Alzheimer tek bir arıza noktasının hastalığından çok bakım düzenlemesinin bozulması gibi görünüyor; bu yüzden riski artıran ya da azaltan çok sayıda unsur var
    Önleme çok daha iyi hale gelip görülme sıklığını beşte bire düşürebilir ya da belirtilerin ortaya çıkışını yaşam süresinin ötesine erteleyebilir belki, ama tek bir "tedavi" olacağı beklentisi daha çok bir temenni gibi
    Ayrıca bir topaç gibi, eksen bir kez yalpalamaya başladı mı sistemi eski kararlı hâline döndürmek çok zor; en fazla biraz yavaşlatmak mümkün olabilir
    Daha rahatsız edici olasılık ise etkili müdahalelerin çoğu sosyal ve yaşam tarzı faktörleri ise insanların bunlardan gerçekten yararlanma seçeneğine sahip olup olmadığı sorusu
    Egzersiz ve aktif yaşam için gereken zaman, enerji, imkân ve kaynaklar düşünüldüğünde bile orta düzeyde koruyucu etkinin zaten bilindiğini görüyoruz

  • Harvard tarafından gelen görece yeni çalışmalarda, beyindeki düşük lityum düzeyinin birçok Alzheimer vakasının nedeni olabileceği hipotezinin yazıda anılmamasına şaşırdım
    Hâlâ erken aşamada ve çoğu fare modeli olsa da, bildiğim kadarıyla insan otopsi beyin dokusundaki farklardan da yola çıkılarak bu hipotez kurulmuştu
    En büyük endişem, tedavi adayının patentlenemeyen yaygın bir takviye olan lithium orotate olması nedeniyle yeterince araştırılmayabilmesi
    Orta yaşlıyım ve aile öyküm de var; ben şimdiden kullanmaya başladım
    On yıllardır takviye olarak satılıyor ve o dozda yan etki olasılığı son derece düşük görünüyor; en kötü ihtimalle biraz para kaybederim, bu da olası demans önleme etkisine kıyasla benim için kabul edilebilir
    Verdiğim örnek kaynak şu
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S027323002...

    • Genel olarak katılıyorum ve uygun dozlarda güvenlik tarafının da epey çalışılmış olduğunu düşünüyorum, ama verdiğiniz çalışma sıçanlarla ilgili; bunu insan güvenliği için kanıt olarak kullanmak uygun değil
      Daha iyi insan çalışmaları bağlantılamak daha doğru olur
      Ben de az bilinen bazı takviyeleri biraz deniyorum ama bu tür çalışmaların varlığı tek başına insanlar için güvenli sonucuna kesinlikle katkı sayılmamalı
      Kendi deneyimimde günde 1 mg bile beni biraz donuklaştırdı ve odaklanmayı zorlaştırdı, bu yüzden iki gün sonra temkinli davranıp bıraktım
      Belki zamanla alışırdım ama sadece bu tepki bile devam etmek istememem için yeterliydi
    • İlginçmiş
      Ben de orotate alıyorum ama diğer yorumda söylendiği gibi beni çok uykulu yaptığı için günde 1 mg’den epey daha az kullanıyorum
      Acaba bu, beynin "çöp temizliği" süreciyle mi ilgili diye düşünmeden edemiyorum
      Bugün daha erken burada Dr Michael Nehls’in demans için lityum önerdiğini söyleyen bir yorum görmüştüm ama şimdi kaybolmuş
    • Aslında bence oldukça basit
      1–5 mg lithium orotate, vitamin D, polifenolü yüksek algae bazlı omega-3, her gün egzersiz ve ABD’de yaygın olan işlenmiş gıdalar yerine düzgün besinler yeterli
      Büyükannem 94 yaşında ve hâlâ zihni son derece açık; bu beni her seferinde şaşırtıyor
      https://michael-nehls.de/
    • Hayır, lityum daha derinde olan bitenin sadece bir kısmını ele alıyor
      Asıl mesele beyindeki düşük glucose transport
      https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8772148/
      APoE e4’ün risk faktörü olmasının sebebi de glikoz taşınmasını düzenlemesi
      https://www.nature.com/articles/s41398-025-03550-w
      Sonuçta beyin enerjisini kaybediyor
    • Bu konuyu her gördüğümde heveslenip deniyorum ama her seferinde kendimi çok kötü hissediyorum
      Benim brain chemistry’m için onsuz olmak daha iyi galiba
  • Metnin tamamını okumadım ama amyloid hypothesis’in arkasında kesinlikle sağlam bir bilimsel temel var
    Alzheimer, APP veya presenilin genlerindeki kalıtsal mutasyonlar nedeniyle ortaya çıkabiliyor ve bu durumda 40 yaş civarında bile başlayabiliyor
    Öte yandan 65 yaş sonrasında görülen sporadik Alzheimer da var ve iki durumda da beyin patolojisi benzer
    Özellikle amiloid APP’den türetiliyor ve presenilin, APP’yi keserek Aβ peptitini oluşturuyor
    Şu an için APP veya presenilin mutasyonlarının yol açtığı erken başlangıçlı AD ile geç başlangıçlı sporadik hastalık arasında, amiloid ve tau patolojilerinin neden benzer olduğunu birlikte açıklayan tek çerçeve amiloid hipotezi
    Dahası, Alzheimer’a neden olan APP mutasyonlarının tamamı molekülün geri kalan %95’inde değil, Aβ amyloid’e karşılık gelen ya da hemen bitişiğindeki bölgede kümelenmiş durumda
    Bu gözlemleri bir arada açıklayan başka bir teori çıkana kadar bu hipotezi savunanlar olmaya devam edecektir

  • Bence Alzheimer araştırmalarının onlarca yıldır yerinde saymasının nedeni sadece kusurlu amiloid modeli değil, daha büyük ölçekte yaşlanan biotech paradigması
    Sektör uzun süre tek bir biyolojik sorunu çözen hedeflenmiş küçük moleküller aradı ve bu bir vizyon eksikliğinden çok o dönemin teknolojik sınırlarından kaynaklanıyordu
    Ama zincirleme ve tüm vücudu etkileyen bir hastalık olan Alzheimer’ı tek hedefli bir molekülle ele almaya çalışmak, tüm tesisat paslanmışken tek bir boruyu değiştirip sorunun çözüleceğini ummaya benziyor
    Bu temel uyumsuzluk klinik ilerlemeyi tıkadı ve gelecekteki tedavilerin daha çok onkolojinin izlediği yola benzeyeceğini düşünüyorum
    Eskiden kanseri iyileştirecek evrensel molekül aranıyordu, bugünse tümörün mutanomu sekanslanıp kişiye özel müdahaleler tasarlamak daha gerçekçi görülüyor
    Yaşlandıkça nörodejeneratif sistem çökerken de aynı düzeyde biyolojik karmaşıklık ortaya çıkıyor
    Geleneksel tek bir küçük molekülle küresel ölçekte çöken bir ağı kurtarmak zor
    Gerçek atılımın, sermaye bu eski tek hedefli boru hattından çıkıp ciddi biçimde programmable biological systems alanına kaydığında gelmesi daha olası