Raspberry Pi 4B'de Rosetta@home çalıştırmak feat. Docker

Kısa süre önce, BOINC tabanlı protein katlanma analizi projesi Rosetta@Home'un ARM64 mimarisi istemcisini desteklemeye başladığı haberi vardı. ( https://tomshardware.com/news/… ) Bununla bağlantılı olarak, Raspberry Pi 4B'ye Docker kurup onun üzerinde Rosetta@home hesaplamalarını çalıştırma yöntemini tanıtıyor. (Korece)

Rosetta@home oldukça uzun bir geçmişe sahip bir protein katlanma analizi projesi ve bu kez COVID-19 salgınıyla birlikte söz konusu virüsün yüzeyinde çıkıntı yapan proteinleri analiz etme çalışmasını yürütüyor. Genelde bu tür dağıtık hesaplama işleri yalnızca x86 platformlarında yapılırdı, ancak ARM platformu giderek büyüdükçe artık bu alanda da ARM tabanlı sistemlerin ortaya çıktığı görülüyor. Şu anda bu projeye yaklaşık 194 binden fazla sistem katılıyor ve bunların en fazla yaklaşık 13,1 petaflops düzeyinde hesaplama gücü sunduğu tahmin ediliyor.

Bu çalışmaya katkı verebilecek Raspberry Pi modelleri, 64 bit AP takılı Raspberry Pi 3 veya 4 üzerinde 64 bit Linux çalıştırılan durumlarla sınırlı. Raspberry Pi'de varsayılan olarak sunulan işletim sistemi olan Raspbian 32 bit bir işletim sistemi olduğu için, bunu olduğu gibi kullanarak bu projeye kaynak ayırmak mümkün değil. Ubuntu gibi dağıtımlar Raspberry Pi için 64 bit Linux imajları sunduğundan, bunları kullanmak kritik nokta. Eğer çok kullanılmadan bir kenarda duran bir Raspberry Pi'niz varsa, bu projeye siz de katılmayı düşünebilirsiniz.