Açık, titiz ve yeniden üretilebilir araştırma: Uygulayıcılar için el kitabı (2021)

Araştırma tasarımı aşaması

• Araştırma sorusunu tanımlama
• Araştırma tasarımını seçme
• Çeşitli araştırma tasarımlarını tanıma
• Tahminde ortaya çıkan hata/belirsizliğin farklı nedenlerini tanıma
• Çeşitli veri kaynaklarında ve araştırma tasarımlarında tipik yanlılıklar
• Farklı hata türlerini azaltma ve tahmin yöntemleri
• Analiz planı oluşturma
• Büyük ölçekli araştırmaların dokümantasyonuna başlama

Analiz aşaması

• Buradan başlayın
• İstatistiksel analiz planı (SAP)
• Veri üretimi
• Veri hazırlama
• Veri görselleştirme
• Veri özetleme
• Veri analizi
• Tıp alanında veri analizi
• İstatistiksel analiz raporu
• Örnekler
• Kaynaklar

Yayın aşaması

• Veriyi açık hale getirme
• Kodu açık hale getirme
• Yeniden üretilebilir ortam
• Açık yayın modeli
• Süreç ve kararların dokümantasyonu
• Ek materyaller

Önsöz

• Araştırmanın faydasını artırmak için yapılabilecek çok şey olduğu varsayımıyla başlar.
• Erişimin kısıtlı olması, analizin karmaşıklığı, veri veya yazılıma erişim sorunları gibi nedenlerle araştırmanın şeffaf ve yeniden üretilebilir bir şekilde yürütülmemesi durumunda ortaya çıkan başlıca sınırlamaları ele alır.
• Araştırmayı daha açık, şeffaf ve yeniden üretilebilir hale getirmeye yönelik çabaların neden yetersiz kaldığını açıklar.

Yazarlar ve teşekkür

• Yazarlar Stanford Üniversitesi ve Google Health'te araştırma yürütüyor; sırasıyla makine öğrenimi, epidemiyoloji ve nüfus sağlığı ile veri bilimi alanlarında doktora derecelerine sahipler.
• İlk okurlara, Stanford Data Science Initiative topluluğuna, Russ Poldrack, John Chambers ve Steve Goodman'a teşekkür ederler.

GN⁺ görüşü

Bu yazının en önemli yanı, araştırmayı daha açık, şeffaf ve yeniden üretilebilir hale getirmenin yollarını göstermesidir; bu da bilimsel keşiflerin güvenilirliğini artırıp araştırma sonuçlarının kullanım değerini yükseltebileceği için ilgi çekicidir. Araştırma tasarımı, veri analizi ve yayıncılığın her aşamasında pratik ve modüler bir yaklaşım sunarak, yoğun çalışan bilim insanlarının araştırmalarını daha iyi yürütüp paylaşmalarına yardımcı olması açısından da caziptir.